Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Becn2P0DM65 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Becn2P0DM65 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Becn2P0DM65 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Becn2P0DM65 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Becn2P0DM65 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Becn2P0DM65 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Becn2P0DM65 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Becn2P0DM65 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Becn2P0DM65 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms