Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprqP0C5E4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprqP0C5E4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprqP0C5E4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms