Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa5P09021 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa5P09021 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa5P09021 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms