Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spta1P08032 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spta1P08032 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spta1P08032 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spta1P08032 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spta1P08032 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spta1P08032 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Spta1P08032 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spta1P08032 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spta1P08032 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spta1P08032 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spta1P08032 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spta1P08032 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spta1P08032 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spta1P08032 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms