Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-AaP01910 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-AaP01910 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2-AaP01910 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-AaP01910 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-AaP01910 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-AaP01910 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms