Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01787 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01787 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01787 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01787 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01787 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01787 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01787 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01787 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01787 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01787 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01787 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01787 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01787 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01787 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01787 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01787 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01787 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01787 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01787 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01787 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01787 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01787 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01787 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01787 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01787 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01787 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01787 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01787 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01787 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01787 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01787 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01787 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01787 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01787 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01787 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01787 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01787 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01787 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01787 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01787 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01787 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01787 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01787 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01787 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01787 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01787 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01787 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01787 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01787 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01787 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01787 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01787 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01787 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01787 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01787 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01787 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01787 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01787 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01787 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01787 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms