Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01748 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01748 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01748 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01748 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01748 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01748 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01748 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01748 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01748 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01748 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01748 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01748 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01748 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01748 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01748 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01748 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01748 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01748 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01748 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01748 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01748 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01748 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01748 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01748 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01748 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01748 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01748 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01748 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01748 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01748 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01748 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01748 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01748 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01748 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01748 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01748 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01748 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01748 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01748 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01748 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01748 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01748 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01748 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01748 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01748 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01748 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01748 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01748 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01748 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01748 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01748 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01748 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01748 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01748 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01748 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01748 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01748 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01748 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01748 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01748 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01748 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01748 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01748 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01748 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01748 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01748 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01748 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01748 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01748 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01748 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01748 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01748 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01748 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01748 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01748 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01748 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01748 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01748 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01748 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01748 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01748 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms