Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01641 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01641 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01641 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01641 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P01641 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01641 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01641 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01641 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01641 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01641 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01641 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01641 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01641 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01641 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01641 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01641 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01641 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01641 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01641 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01641 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
P01641 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01641 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01641 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01641 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
P01641 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01641 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01641 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01641 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01641 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01641 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01641 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01641 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01641 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01641 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01641 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01641 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01641 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01641 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01641 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01641 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01641 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01641 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01641 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P01641 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P01641 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P01641 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01641 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01641 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01641 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01641 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01641 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01641 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01641 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01641 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01641 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01641 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01641 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01641 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01641 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01641 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01641 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01641 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01641 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01641 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
P01641 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01641 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01641 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01641 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
P01641 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01641 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
P01641 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01641 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01641 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01641 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01641 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01641 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01641 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01641 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01641 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01641 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01641 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01641 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01641 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01641 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01641 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P01641 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01641 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms