Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01629 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01629 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01629 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01629 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01629 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01629 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01629 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01629 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01629 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01629 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01629 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01629 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01629 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01629 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01629 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01629 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01629 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01629 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01629 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01629 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01629 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01629 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01629 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01629 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01629 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01629 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01629 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P01629 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01629 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01629 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01629 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
P01629 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
P01629 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01629 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01629 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01629 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01629 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01629 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01629 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01629 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01629 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01629 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01629 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01629 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P01629 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01629 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01629 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01629 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01629 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01629 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01629 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01629 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01629 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01629 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01629 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01629 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P01629 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01629 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01629 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P01629 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01629 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01629 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01629 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01629 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01629 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01629 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01629 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01629 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01629 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01629 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01629 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01629 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01629 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01629 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01629 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01629 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01629 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01629 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01629 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01629 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01629 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01629 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01629 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01629 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01629 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01629 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01629 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01629 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01629 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01629 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01629 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P01629 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01629 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms