Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ShdO88834 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ShdO88834 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ShdO88834 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShdO88834 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShdO88834 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShdO88834 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShdO88834 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShdO88834 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShdO88834 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShdO88834 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShdO88834 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShdO88834 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShdO88834 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShdO88834 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ShdO88834 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShdO88834 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShdO88834 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShdO88834 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShdO88834 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShdO88834 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShdO88834 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShdO88834 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShdO88834 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShdO88834 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShdO88834 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShdO88834 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShdO88834 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShdO88834 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ShdO88834 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShdO88834 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShdO88834 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShdO88834 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShdO88834 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShdO88834 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ShdO88834 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShdO88834 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShdO88834 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShdO88834 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShdO88834 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShdO88834 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ShdO88834 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShdO88834 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShdO88834 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShdO88834 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ShdO88834 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ShdO88834 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ShdO88834 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ShdO88834 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ShdO88834 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ShdO88834 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ShdO88834 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ShdO88834 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ShdO88834 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ShdO88834 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ShdO88834 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ShdO88834 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ShdO88834 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ShdO88834 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ShdO88834 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ShdO88834 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ShdO88834 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ShdO88834 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ShdO88834 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ShdO88834 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ShdO88834 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ShdO88834 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ShdO88834 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ShdO88834 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ShdO88834 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ShdO88834 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ShdO88834 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ShdO88834 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ShdO88834 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ShdO88834 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ShdO88834 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ShdO88834 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ShdO88834 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ShdO88834 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ShdO88834 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ShdO88834 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ShdO88834 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ShdO88834 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ShdO88834 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ShdO88834 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ShdO88834 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ShdO88834 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ShdO88834 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ShdO88834 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ShdO88834 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ShdO88834 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ShdO88834 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms