Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3aO88508 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3aO88508 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt3aO88508 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt3aO88508 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnmt3aO88508 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms