Protein–RNA interactions for Protein: O88495

Gpr50, Melatonin-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr50O88495 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpr50O88495 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpr50O88495 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr50O88495 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr50O88495 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms