Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AurkcO88445 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkcO88445 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkcO88445 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkcO88445 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkcO88445 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkcO88445 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkcO88445 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkcO88445 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkcO88445 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkcO88445 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkcO88445 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AurkcO88445 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AurkcO88445 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AurkcO88445 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AurkcO88445 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AurkcO88445 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AurkcO88445 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkcO88445 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkcO88445 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkcO88445 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkcO88445 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms