Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AvilO88398 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AvilO88398 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AvilO88398 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AvilO88398 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AvilO88398 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AvilO88398 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AvilO88398 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AvilO88398 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AvilO88398 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AvilO88398 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AvilO88398 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AvilO88398 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AvilO88398 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AvilO88398 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AvilO88398 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AvilO88398 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AvilO88398 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AvilO88398 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AvilO88398 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AvilO88398 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AvilO88398 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AvilO88398 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AvilO88398 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AvilO88398 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AvilO88398 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AvilO88398 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AvilO88398 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AvilO88398 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AvilO88398 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AvilO88398 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AvilO88398 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AvilO88398 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AvilO88398 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AvilO88398 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AvilO88398 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AvilO88398 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AvilO88398 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AvilO88398 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AvilO88398 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AvilO88398 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AvilO88398 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AvilO88398 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AvilO88398 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AvilO88398 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AvilO88398 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AvilO88398 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AvilO88398 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AvilO88398 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AvilO88398 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AvilO88398 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AvilO88398 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AvilO88398 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AvilO88398 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AvilO88398 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AvilO88398 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AvilO88398 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AvilO88398 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AvilO88398 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AvilO88398 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AvilO88398 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AvilO88398 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AvilO88398 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AvilO88398 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AvilO88398 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AvilO88398 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AvilO88398 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AvilO88398 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AvilO88398 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AvilO88398 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AvilO88398 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
AvilO88398 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AvilO88398 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AvilO88398 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AvilO88398 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AvilO88398 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AvilO88398 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AvilO88398 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AvilO88398 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AvilO88398 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AvilO88398 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AvilO88398 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AvilO88398 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AvilO88398 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AvilO88398 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AvilO88398 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AvilO88398 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AvilO88398 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AvilO88398 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AvilO88398 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms