Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx3O70492 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx3O70492 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx3O70492 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx3O70492 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx3O70492 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx3O70492 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx3O70492 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx3O70492 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx3O70492 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx3O70492 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms