Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ChadO55226 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChadO55226 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChadO55226 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChadO55226 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChadO55226 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChadO55226 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChadO55226 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChadO55226 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChadO55226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChadO55226 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChadO55226 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChadO55226 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ChadO55226 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms