Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Supt5hO55201 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Supt5hO55201 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Supt5hO55201 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Supt5hO55201 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Supt5hO55201 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Supt5hO55201 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt5hO55201 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt5hO55201 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt5hO55201 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Supt5hO55201 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Supt5hO55201 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Supt5hO55201 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Supt5hO55201 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Supt5hO55201 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Supt5hO55201 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt5hO55201 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms