Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pja1O55176 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pja1O55176 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja1O55176 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja1O55176 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja1O55176 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja1O55176 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja1O55176 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja1O55176 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja1O55176 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja1O55176 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pja1O55176 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pja1O55176 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms