Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-ObO35424 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-ObO35424 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-ObO35424 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms