Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna3O35344 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kpna3O35344 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna3O35344 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna3O35344 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna3O35344 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms