Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Polr1aO35134 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Polr1aO35134 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Polr1aO35134 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Polr1aO35134 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Polr1aO35134 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Polr1aO35134 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Polr1aO35134 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Polr1aO35134 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Polr1aO35134 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Polr1aO35134 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms