Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcof1O08784 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tcof1O08784 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcof1O08784 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcof1O08784 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tcof1O08784 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcof1O08784 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tcof1O08784 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcof1O08784 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcof1O08784 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcof1O08784 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tcof1O08784 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcof1O08784 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tcof1O08784 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcof1O08784 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcof1O08784 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcof1O08784 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcof1O08784 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcof1O08784 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms