Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm379J3QQ19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Gm379J3QQ19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm379J3QQ19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Gm379J3QQ19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm379J3QQ19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Gm379J3QQ19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm379J3QQ19 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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