Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkal1J3QPP8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkal1J3QPP8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkal1J3QPP8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alkal1J3QPP8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Alkal1J3QPP8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alkal1J3QPP8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms