Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8298J3QPI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm8298J3QPI0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8298J3QPI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm8298J3QPI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm8298J3QPI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8298J3QPI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm8298J3QPI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms