Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm8356J3QPD3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8356J3QPD3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8356J3QPD3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8356J3QPD3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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