Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC024978J3QPC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC024978J3QPC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC024978J3QPC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BC024978J3QPC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BC024978J3QPC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BC024978J3QPC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms