Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5294J3QP53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5294J3QP53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5294J3QP53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5294J3QP53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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