Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610028H24RikG5E8K1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610028H24RikG5E8K1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610028H24RikG5E8K1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms