Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HrcG5E8J6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
HrcG5E8J6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HrcG5E8J6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HrcG5E8J6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HrcG5E8J6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HrcG5E8J6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HrcG5E8J6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HrcG5E8J6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
HrcG5E8J6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HrcG5E8J6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HrcG5E8J6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
HrcG5E8J6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HrcG5E8J6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
HrcG5E8J6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
HrcG5E8J6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms