Protein–RNA interactions for Protein: G3XA45

Vmn2r69, MCG59833, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r69G3XA45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r69G3XA45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r69G3XA45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn2r69G3XA45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r69G3XA45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r69G3XA45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r69G3XA45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms