Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
BicraF8VPZ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BicraF8VPZ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
BicraF8VPZ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
BicraF8VPZ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
BicraF8VPZ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BicraF8VPZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
BicraF8VPZ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
BicraF8VPZ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
BicraF8VPZ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
BicraF8VPZ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
BicraF8VPZ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms