Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ercc6F8VPZ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Ercc6F8VPZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ercc6F8VPZ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ercc6F8VPZ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Ercc6F8VPZ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Ercc6F8VPZ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ercc6F8VPZ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Ercc6F8VPZ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Ercc6F8VPZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ercc6F8VPZ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ercc6F8VPZ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ercc6F8VPZ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ercc6F8VPZ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Ercc6F8VPZ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ercc6F8VPZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ercc6F8VPZ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
Ercc6F8VPZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ercc6F8VPZ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ercc6F8VPZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms