Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7945F6QI24 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7945F6QI24 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7945F6QI24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm7945F6QI24 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms