Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc141E9Q8Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc141E9Q8Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc141E9Q8Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc141E9Q8Q6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc141E9Q8Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc141E9Q8Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc141E9Q8Q6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms