Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r35E9Q7U8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r35E9Q7U8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r35E9Q7U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r35E9Q7U8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r35E9Q7U8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms