Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Urb2E9Q7L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Urb2E9Q7L1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Urb2E9Q7L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Urb2E9Q7L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Urb2E9Q7L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Urb2E9Q7L1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Urb2E9Q7L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Urb2E9Q7L1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Urb2E9Q7L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms