Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UtrnE9Q6R7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UtrnE9Q6R7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UtrnE9Q6R7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UtrnE9Q6R7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UtrnE9Q6R7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UtrnE9Q6R7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UtrnE9Q6R7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UtrnE9Q6R7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UtrnE9Q6R7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms