Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Simc1E9Q6E9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Simc1E9Q6E9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Simc1E9Q6E9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Simc1E9Q6E9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Simc1E9Q6E9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Simc1E9Q6E9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Simc1E9Q6E9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Simc1E9Q6E9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Simc1E9Q6E9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms