Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17728E9Q5K2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17728E9Q5K2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17728E9Q5K2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17728E9Q5K2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17728E9Q5K2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17728E9Q5K2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17728E9Q5K2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17728E9Q5K2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms