Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr1E9Q0B4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cdr1E9Q0B4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdr1E9Q0B4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr1E9Q0B4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms