Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph10bE9PYQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rsph10bE9PYQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rsph10bE9PYQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms