Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU018091E9PWS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU018091E9PWS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AU018091E9PWS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU018091E9PWS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms