Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc62E9PVD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc62E9PVD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc62E9PVD1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc62E9PVD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc62E9PVD1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc62E9PVD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc62E9PVD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms