Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp839E9PUU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp839E9PUU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp839E9PUU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp839E9PUU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp839E9PUU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms