Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
4930407I10RikD3Z5T8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
4930407I10RikD3Z5T8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
4930407I10RikD3Z5T8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
4930407I10RikD3Z5T8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
4930407I10RikD3Z5T8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
4930407I10RikD3Z5T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
4930407I10RikD3Z5T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
4930407I10RikD3Z5T8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
4930407I10RikD3Z5T8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms