Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed7D3YZZ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed7D3YZZ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed7D3YZZ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed7D3YZZ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed7D3YZZ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed7D3YZZ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed7D3YZZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms