Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rexo5D3YW29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo5D3YW29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rexo5D3YW29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rexo5D3YW29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rexo5D3YW29 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rexo5D3YW29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms