Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx8D3YU81 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx8D3YU81 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx8D3YU81 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx8D3YU81 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx8D3YU81 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
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