Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smok3bC0HKC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smok3bC0HKC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smok3bC0HKC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smok3bC0HKC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms